Evo——一种基于人工智能的模型，用于破译和设计基因序列
作者：by Bob Yirka , Phys.org
Arc 研究所和斯坦福大学的计算机科学家、生物工程师和人工智能专家开发了一种基于人工智能的模型，能够解码和设计基因序列。在他们的纸发表在期刊上科学，该小组描述了设计和构建模型的因素，他们将其命名为 Evo，并列出了该模型的多种可能用途。
格拉德斯通心血管疾病研究所的克里斯蒂娜·西奥多里斯 (Christina Theodoris) 发表了一篇透视片在同一期期刊中，概述了研究人员所做的工作，并建议 Evo 的开发可能对以下领域产生重大影响：医学研究并治疗未来的疾病。
随着 ChatGPT 等法学硕士的出现，计算机科学家已经开发出的工具可能会产生远远超出文本、图像或视频生成的影响。用大量数据训练计算机以帮助其学习，为广泛的研究机会打开了大门。在这项新研究中，研究人员用 DNA 数据训练了一台计算机，然后用它来创造新的东西。这模型Evo不仅可以解码基因序列，还可以设计新的基因序列。
研究小组用数据对 Evo 进行了训练，这些数据显示 DNA 链如何随着时间的推移而进化，以及这些变化在给定的有机体中产生了什么。例如，在收到多种细菌的多个样本后，Evo 了解了它们的 DNA 是如何运作的。这使得该模型能够设计一个全新的微生物基因组。
为了使其具有基本的使用水平，研究人员使用 270 万个微生物基因组对 Evo 进行了训练，其中包括来自针对病毒的细菌类型的数百万个基因序列，这个过程花了四个星期。值得注意的是，该模型能够读取核苷酸水平的数据，使其能够了解即将产生的 DNA 链的构建模块。
该模型的初始测试包括要求 Evo 预测在特定突变的情况下蛋白质会发生什么。他们将其结果与人类在实验室中进行的实验结果进行了比较，发现它们具有可比性。不同之处在于，Evo 能够在几分钟内完成科学家们花费多年努力的工作。
研究小组表示，他们的模型很快就会改变这种方式合成生物学进行。
更多信息：Eric Nguyen 等人，使用 Evo 从分子到基因组规模进行序列建模和设计，科学（2024）。DOI：10.1126/science.ado9336
克里斯蒂娜·V·西奥多里斯 (Christina V. Theodoris)，《学习 DNA 语言》，科学（2024）。DOI：10.1126/science.adt3007
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引文:Evo——基于人工智能的模型，用于破译和设计基因序列（2024 年，11 月 15 日）检索日期：2024 年 11 月 16 日来自 https://phys.org/news/2024-11-evo-ai-based-deciphering-genic.html
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