作者:Liang, Yao-Jen
骨质疏松症被定义为一种系统性骨骼疾病,其特征为低骨量、骨组织微结构恶化、骨脆性增加以及易发生骨折。1这种情况由于其严重性、慢性以及进行性被视作21世纪的隐形流行病。2它是一个重大的全球公共卫生问题,主要原因是老年人群中由骨质疏松性骨折导致的高发病率。32010年,在欧洲联盟内,大约有550万男性和2200万女性患有骨质疏松症。4令人震惊的是,80%的受影响女性在被诊断前都未意识到自己的风险因素5患有骨质疏松症的个体骨折的风险更高。仅在英国,每年就有大约79,000人遭受髋部骨折,给患者和医疗体系带来了高达35亿英镑的巨大费用。预计到2025年,这一成本将上升至每年55亿英镑。6而且,在经历髋部骨折后,发病率和死亡率会有显著增加,每年有31,000人在骨折后的六个月内死亡。7因此,骨质疏松症的早期预防、诊断和管理已成为医疗提供者和政府共同关注的重要公共卫生问题。
世界卫生组织根据骨矿物质密度(BMD)的标准差建立了诊断标准,将其与年轻健康女性的峰值骨量进行比较。根据这些标准,当T值小于-2.5时定义为骨质疏松症,而T值介于-1和-2.5之间则被定义为骨量减少。这些诊断标准对于理解低BMD在脆性骨折发展中的意义做出了重要贡献,并为流行病学研究提供了评估骨质疏松症发病率的宝贵工具。8.
传统上,医学研究依赖于多元线性回归(MLR)来探究风险因素与结果(并发症)之间的关系。然而,随着人工智能和机器学习(Mach-L)的出现,数据分析的新方法也随之诞生,其中机器可以从过去的数据或经验中学习而无需显式编程。如今,Mach-L已经成为MLR的一个竞争替代品。9,10,11Mach-L的主要优势之一是它能够捕捉数据中的非线性关系,并理解多个预测因子之间的复杂交互作用,这使得它在疾病预测方面可能比传统的多元线性回归(MLR)更有效。12.
据我们所知,虽然过去进行了许多纵向研究,但只有少数研究专门关注骨质疏松症中最复杂和关键的指标之一——T分数(δ-T分数)之间的差异。因此,在这项研究中,我们采用了四种不同的机器学习(ML)方法,并旨在回答以下问题:在一个四年随访的糖尿病患者队列中:
比较Mach-L方法与传统多元线性回归(MLR)的预测准确性。
根据预测δ-T评分未来变化的重要性,对各种风险因素进行排序,包括人口统计学、生活方式和生物化学数据。
本研究的数据来自台湾MJ队列,这是一个由台湾MJ健康检查中心进行的持续性前瞻性健康检查队列。10,11,12,13,14这些全面的检查涵盖了超过100个基本生物指标,包括人体测量、血液检测和影像学检测等。此外,每位参与者完成了一份自填问卷,提供了个人及家族医疗史、当前健康状况、生活方式、体育锻炼、睡眠习惯和饮食习惯的信息。10,11,12,13,14,15只有提供了知情同意的参与者才被纳入MJ健康数据库,且研究方案已由高雄国防-general医院机构审查委员会批准(IRB编号:KAFGHIRB 109 − 041)。队列的描述此前已由我们小组发表。16在本研究中,所有方法均按照我们机构的相关指南和规定进行。最初共纳入了3,412名55岁及以上的健康女性,排除各种原因后的受试者为1,698人,如图所示。1支持本研究发现的数据可以从MJ诊所获得,但这些数据的可用性受到限制,因为它们是根据许可用于当前研究的,并且不公开提供。然而,在合理请求并获得MJ诊所许可的情况下,数据可从通讯作者处获取。
在研究当天,资深护理人员记录了每位受试者的医疗历史,包括任何当前用药的信息,并进行了体格检查。腰围水平测量位于自然腰部位置,体质指数(BMI)计算为受试者体重(kg)除以其身高的平方(m)。使用标准的汞血压计测量每位受试者在坐姿下右臂的收缩压(SBP)和舒张压(DBP)。
收集人口统计学和生化数据的程序与之前发表的方法一致。13禁食10小时后,采集血液样本进行生化分析。血浆在采血后的1小时内从血液中分离出来,并储存在-30°C下,直到分析空腹血浆葡萄糖(FPG)和脂质谱型。使用葡萄糖氧化酶法测量FPG(YSI 203 葡萄糖分析仪;Yellow Springs Instruments, Yellow Springs, OH, USA)。总胆固醇和甘油三酯(TG)水平采用干式多层分析片方法,通过Fuji Dri-Chem 3000 分析仪(富士胶卷,日本东京)进行测定。使用酶法胆固醇测定,在葡聚糖硫酸沉淀后测定血清高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)和低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)的浓度。此外,通过浊度法使用贝克曼库尔特AU 5800生化分析仪测定尿白蛋白与肌酐比值(ACR)。T 分数通过双能量X射线吸收测定法测量(Lunar, General Electric Company, USA)。
数据以均值±标准差的形式表示。为了评估男性和女性连续变量之间的差异,使用了Student t检验。此外,使用Pearson相关分析了δ-T评分与其他所有变量之间的关系。所有的统计检验均为双侧检验,并且p值小于0.05被认为具有统计学意义。统计分析使用的是SPSS 10.0 for Windows(SPSS, Chicago, IL, USA)。
本研究提出了一种基于四种不同的机器学习(Mach-L)方法的方案,即随机森林(RF)、极端梯度提升(XGBoost)、朴素贝叶斯(NB)和随机梯度提升(SGB),来构建预测模型以预测四年后δ-BMD的变化。这些Mach-L方法在各种医疗保健应用中得到了广泛的应用,并且不依赖于关于数据分布的先验假设。14,15,17,18,19,20,21,22,23,24这部分方法已由我们小组发表25.
随机森林(RF)是一种结合了自助法重抽样和装袋的决策树集成学习算法。26其原理涉及随机生成多个不同的未经修剪的CART决策树,其中使用吉尼不纯度的减少作为分裂准则。所有生成的树随后被组合成一个森林。最终模型是通过在森林中的所有树木之间进行平均或投票来生成输出概率并确保鲁棒性而获得的。27.
下一个方法SGB是一种基于树的梯度提升学习算法,结合了袋式法(bagging)和提升法(boosting)技术来最小化损失函数,并解决传统决策树的过拟合问题。28,29,30在SGB中,通过多次迭代顺序生成许多随机弱学习器(树)。每个树专注于纠正或解释前一轮树的错误,以前一轮树的残差作为新生成树的输入。这一迭代过程持续进行,直到达到停止标准,例如最大迭代次数或收敛条件。最终,使用多个树的累积结果来确定最终的鲁棒模型。
第三种方法是NB,这是一种流行的Mach-L分类模型。该算法可以根据特定的特征和变量对对象进行排序,并使用贝叶斯定理计算假设在假定群体中的概率。31与逻辑回归不同,像NB这样的Mach-L方法不需要强烈的前提假设,并且能够捕捉到经验数据中存在的微妙的非线性关系。14.
关于XGBoost,它是本研究中使用的最后一种方法,它是一种基于SGB优化扩展的梯度提升技术。32XGBoost的基本原理是顺序训练许多弱模型,并使用梯度提升方法将它们组合起来以实现更好的预测性能。为了加速模型构建的收敛过程,XGBoost采用泰勒二项式展开来近似目标函数,并利用任意可微的损失函数。33此外,XGBoost应用了正则化的提升技术来惩罚模型的复杂度,从而纠正过拟合并提高模型准确性。32.
图2介绍了结合四种机器学习(ML)方法的预测和重要变量识别方案的流程图。最初,收集患者数据并通过提议的方法准备数据集。随后,将数据集随机分成80%用于模型构建的训练数据集和20%用于模型评估的测试数据集。在训练过程中,通过特定的超参数对每个机器学习方法进行微调以构建性能良好的模型。为此,采用10折交叉验证(CV)技术进行超参数调整。训练数据集进一步划分为具有不同超参数设置的训练子集和用于模型验证的验证子集。网格搜索探索了所有可能的超参数组合。对于每个ML方法而言,验证子集中根均方误差最低的模型被认为是最好的模型。因此,最佳调优后的随机森林(RF)、梯度提升树(SGB)、朴素贝叶斯(NB)和XGBoost模型被生成,并获得了相应的变量重要性排名信息。
对于测试过程,使用了测试数据集来评估最佳随机森林(RF)、梯度提升机(SGB)、朴素贝叶斯(NB)和XGBoost模型的预测性能。由于本研究中的目标变量是一个数值型变量,因此模型性能比较采用了对称平均绝对百分比误差(SMAPE)、相对绝对误差(RAE)、平方根相对误差(RRSE)和均方根误差(RMSE)等指标,这些指标在表中给出。1SMAPE 是一种有用且平衡的方法,用于验证预测结果的平均百分比误差。基础 MAPE 公式仅将实际值的绝对值放入分母中,这限制了任何实例的实际值不能为零或非常小的情况。作为替代方案,使用了 SMAPE。RAE 的计算方法是将预测值和实际值之间的绝对差值之和除以实际值与实际值平均值之间绝对差值之和。此指标提供了一种直观的方式来评估模型相对于简单基线的准确性,因此对于比较不同的预测方法很有用。RMSE 通过取预测值和实际值之间平方差异的平均值的平方根来计算,RMSE 对更大的误差惩罚更重,使其对异常值敏感,并清晰地表明了模型的准确性。RRSE 是通过将预测值与实际值之间的平方差之和除以实际值与实际值平均值之间的平方差之和,然后取结果的平方根来确定。SMAPE、RAE、RRSE 和 RMSE 的较低数值表示更好的预测性能,因为这意味着模型的预测值更接近于实际值。
为了确保稳健的比较,上述训练和测试过程被随机重复了10次。然后利用RF、SGB、NB和XGBoost模型的平均指标来与基准MLR模型进行对比,该基准模型使用了相同的训练和测试数据集作为Mach-L方法。如果一个Mach-L模型的平均指标低于MLR,则认为这是一个令人信服的模型。
由于本研究中使用的所有Mach-L方法都可以生成每个预测变量的重要性排名,我们根据每个模型中的排名为每个变量分配优先级,排名第1的变量是最关键的风险因素,而排名第22的变量则最为不重要。然而,不同的Mach-L方法可能会因为其独特的建模特性而导致不同的变量重要性排名。为了增强重新排列风险因素重要性的稳定性和完整性,我们整合了来自令人信服的Mach-L模型的变量重要性排名。
在提议方案的最后阶段,我们根据令人信服的Mach-L模型的结果进行了总结和讨论。这一过程使我们能够识别出对四年随访后δ-T评分预测有显著贡献的重要变量。
在这项研究中,所有方法均使用安装了所需包的R软件版本4.0.5和RStudio版本1.1.453完成。34RF、SGB、NB 和 XGBoost 的实现是 R 包 "randomForest" 版本 4.6-1435"gbm" R包版本2.1.836"rpart" R包版本 4.1-1537以及“XGBoost” R包版本1.5.0.2 соответственно (注意:最后一词“соответственно”似乎是俄语,原文中没有对应的词汇,所以这部分可能是多余的或者翻译出现了偏差。根据上下文和要求,仅提供直接翻译部分,即: 以及“XGBoost” R包版本1.5.0.2)38此外,为了估计为开发的有效NB、RF、SGB和XGBoost方法确定的最佳超参数集合,使用了“caret”R包版本6.0–9039MLR使用“stats”R包版本4.0.5实现,并且使用默认设置构建模型。
共有1698名参与者纳入研究。人口统计学数据见表2(均值±标准偏差)。在表中3皮尔森相关性的结果显示,可以注意到年龄、教育程度、
BMI、HDL-C 和 TSH 与 δ-T 分数呈正相关,而血浆钙水平和基线 T 分数与 δ-T 分数呈负相关。表 4展示了独立变量与δ-TS之间的简单相关性。可以注意到,年龄、教育水平、BMI、HDL-C和TSH与δ-TS呈正相关。相反,血浆钙、磷和基线BMD与δ-TS呈负相关。
传统MLR与四种Mach-L方法预测δ-TS的结果如表所示。5从表中可以看出,所有的四种Mach-L方法都比MLR方法产生了更低的预测误差,并且都是令人信服的Mach-L模型。
表格6展示了由RF、SGB、NB和XGBoost方法生成的每个因素的变量重要性和它们的排名。从图中可以看出,不同的Mach-L方法为每个因素生成了不同的相对变量重要性。右列给出了这些变量的排名。蓝色的深浅表示风险因素的重要性。最后,在图中。3,上述关系的图形说明如下:图中将最重要的变量置于顶部位置,最不重要的变量置于底部。从表格中可以看出,教育水平是δ-T评分最重要因素,其次是DBP(舒张压)、吸烟、SBP(收缩压)、UA(尿酸)、年龄和LDL-C。最后,使用基于RF(随机森林)、XGBoost、NB(朴素贝叶斯)和SGB的模型的SHAP值来可视化输入特征对输出的影响,如图所示。4.
在本研究中,我们采用了四种Mach-L方法来确定预测4年后δ-T评分的风险因素的重要性。值得注意的是,所有四种方法都表现出比LR更低的误差(如表所示)。4),表明在这一背景下Mach-L优于LR。根据它们的重要性,我们确定了六个因素,下面将详细讨论这些因素。重要的是要强调,我们的研究重点是将δ-T分数作为独立变量,这与其他主要考察随访期结束时T分数的常规研究区分开来。尽管过去曾有类似的研究发表,但那些研究样本量较小且未使用Mach-L(表 7).
我们的结果显示,DBP和SBP分别是影响δ T-score的最重要和第二重要的因素。然而,需要注意的是,在皮尔逊相关分析中观察到的DBP和SBP与δ-T score之间的关联并不具有统计学意义。皮尔逊相关和Mach-L方法之间存在的差异可以归因于Mach-L的特点,即相比MLR更能捕捉非线性关系。尽管在皮尔逊相关分析中缺乏统计学意义,我们的研究结果与Lee等人进行的一项韩国研究所观察到的结果一致。18调整混杂因素后,他们发现股骨颈T值与DBP呈负相关关系,系数为0.391(95%置信区间:0.766至0.016)p= 0.041)。另一方面,腰椎骨密度和T值与收缩压呈正相关,系数为0.395(95%置信区间:0.058–7.752,p= 0.047) 和 0.458(95% 置信区间:0.005–0.911,p= 0.047) 分别。这些关联表明血压可能对不同骨骼部位的骨密度有不同的影响。重要的是要认识到,在 Lee 等人进行的研究中,根据血压或骨质疏松症的状态将队列分为两组,并且使用了与我们研究不同的逻辑回归分析方法。因此,在比较他们的发现与我们的发现时,必须谨慎对待由于研究设计和统计方法的不同而产生的差异。尽管收缩压的正相关和舒张压的负相关是出乎意料的,但这些结果有合理的解释。首先,正如之前的研究所报道的那样,不同骨骼部位的骨密度测量可能存在不一致。40,41,42,43,44这种骨密度(BMD)测量的差异可能会影响骨密度与血压之间的关系。其次,使用DEXA检查脊柱骨密度时出现的测量误差可能会导致观察到的不一致现象。软组织钙化、骨刺、严重的侧弯或由骨关节炎引起的椎体畸形可能是影响脊柱骨密度测量准确性的潜在错误来源,从而影响其与血压的相关性。最后,股骨和脊柱可能具有不同的生物力学特性,导致它们对各种因素(如身体活动)产生不同的反应。一项研究表明,身体活动可能会对脊柱和股骨颈的骨密度产生不同的影响。45这可能解释了我们在研究中观察到的不同关联。
在我们的研究中,UA水平根据Mach-L方法成为第三个重要的因素。尽管UA与δ-T分数呈正相关,但这种相关性没有统计学意义。这一发现符合尿酸具有抗氧化特性的观点,这可能有助于骨骼保护。假设是尿酸强大的抗氧化特性可能在保持骨健康方面发挥作用。全球范围内进行的许多相关研究探讨了血清尿酸和骨矿物质密度(BMD)以及骨质疏松症之间的关系。46,47,48,49此外,一篇综述文章阐明了尿酸(UA)与骨矿物质密度(BMD)之间的相互作用,并强调了其通过运行相关转录因子2(RUNX2)/核心结合因子亚基α-1(CBF-α-1)、Wnt-3a/β-catenin信号通路以及11β羟皮质类固醇脱氢酶类型1参与的作用。50.
据我们所知,我们的研究是首次尝试进一步确认尿酸(UA)在骨质疏松症中的作用。这支持了这样一个观点,即尿酸可能对骨骼健康有重要影响,值得在未来的研究和骨质疏松症的临床管理中进行更深入的调查和考虑。
在我们的研究中,我们观察到教育水平与δ-T分数之间存在正相关关系。这一发现与其他重要研究结果一致。例如,Piao等人报告了教育水平和T分数之间的正向关系(β=0.092,)p在一项涉及1905名绝经后中国女性的队列研究中,教育水平与骨质疏松症患病率呈负相关(P=0.032)。类似地,其他几项研究也发现了教育水平和骨质疏松症患病率之间的逆向关系。51,52,53,54教育在防治骨质疏松症中的潜在保护作用可归因于几个间接因素,包括社会经济地位、健康素养、生活方式选择以及早期医疗筛查的获取途径。生活方式因素如饮食摄入量、足够的微量元素摄取、身体活动水平、怀孕次数和吸烟习惯已被证实会影响骨密度和骨质疏松症的发生率。较高的教育程度通常与更高的家庭收入、更好的饮食习惯、充足的钙摄入量、定期进行医学检查以及对各种健康状况(包括骨质疏松症)的更大认识有关。55.
例如,先前的研究表明骨密度与营养状况、教育程度和参与体育锻炼有关。56因此,教育赋予的保护作用可能是由于营养状况改善、更遵守医疗建议、更加一致的身体活动以及增强的医疗卫生资源获取能力所致。56,57,58.
类似地,与血压和尿酸一样,甘油三酯水平与δ-T评分呈正相关但无统计学意义。这种关系已被各种研究人员报道过,但结论仍然存在一定的争议。例如,Kim等人发现甘油三酯在男性和女性中都与全身骨密度呈负相关。pP<0.05)。在65岁以上的女性中,调整后的对数TG水平与骨质疏松症的比值比为2.50(95% CI:1.13–5.51)。另一项针对老年 Chinese 人的研究也得出了类似的结论。59相反,有一些其他的研究报告了相反的结果。3,60这种不一致可能源于年龄、性别、骨密度测量方法和种族背景等方面的差异。甘油三酯水平与骨密度的正相关关系可以从几种生物学机制来解释。首先,核激素受体过氧化物酶增殖激活受体γ(PPAR γ)可能在脂质生物标志物与骨密度之间的关系中起作用。PPAR γ可以通过脂质代谢物被激活,并且其水平升高可能导致成骨细胞生成抑制,从而导致骨丢失增加。其次,较高的脂质水平与氧化脂质的增加和较高氧化应激水平相关联。升高的氧化应激可能会抑制成骨细胞分化而促进脂肪细胞分化。第三,血清甘油三酯水平越高,与骨髓脂肪增多呈正相关。61这反过来可能导致 trabecular 骨密度降低。
Mach-L 方法最终选定的变量是睡眠时间。在本研究中,我们观察到睡眠时间和 δ-T 分数之间存在负相关关系。这一发现并不完全令人惊讶,因为关于睡眠时长与骨健康之间的关系仍是一个有争议的话题。我们的研究结果与唐等人(Tang et al.)的工作一致,他们分析了来自 2007-2014 年全国健康和营养调查 (NHANES) 的 4,399 名受试者,并得出结论:不健康的睡眠时长,尤其是过长的睡眠时间,与骨矿物质密度(BMD)降低有关,尤其是在年龄大于60岁的个体、男性或绝经后女性中。然而需要注意的是,他们的研究将队列分为四组并比较了 BMD,这与我们的方法有所不同。62另一方面,李等人报告了相反的结果18他们还使用了NHANES数据,并招募了12,793名受试者。结果显示,与其它组相比,年龄大于50岁的女性每天睡眠时间少于5小时的患骨质疏松症的概率为7.35(置信区间:3.438–15.715)。同样,类似于TG和δ T-评分之间的关系,在不同研究中的差异可能源于正常睡眠时长、睡眠质量、选择的人群、种族以及用于测量骨密度的诊断工具等方面的定义不一。
睡眠对骨代谢和密度潜在影响的机理可能涉及多种机制,包括骨骼细胞正常节律的变化、激素水平(如生长激素、性类固醇、皮质醇)的改变、交感神经张力的增加、炎症、代谢紊乱或疲劳/身体不活跃。之前的证据表明,睡眠结构会随年龄变化。
尽管我们认为我们的研究已经全面完成,但仍存在一些限制。首先,仅测量了腰椎部位,因此我们的发现不能推广到身体的其他部位。其次,样本数量仍然不够大。第三,当应用于其他种族时,也应该考虑单一种族的情况。
我们的研究证明,所有四种Mach-L方法都优于传统的MLR。通过使用Mach-L,我们确定了六项对绝经后中国女性δ-T评分最重要风险因素,按重要性从高到低排序为:舒张压(DBP)、收缩压(SBP)、尿酸(UA)、教育水平、甘油三酯(TG)和睡眠时间。这些发现有助于我们理解这些风险因素与绝经后妇女骨骼健康之间的复杂关系。
支撑本研究发现的数据可从MJ诊所获得,但由于这些数据是根据许可用于当前研究的,因此受到使用限制,并不公开提供。但在合理请求并获得MJ诊所许可的情况下,数据可以从通讯作者处获取。
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