Illumina 与 Nvidia 建立基于人工智能的基因组学合作伙伴关系

旧金山 –Nvidia 在 43 年初宣布的技术领导者合作中表示，Nvidia 将与 Illumina 合作，应用基因组学和人工智能技术来分析和解释药物发现、临床研究和人类健康领域的多组学数据。^RD年度摩根大通医疗保健会议。

Illumina 将通过下一代测序巨头 Illumina Connected Analytics (ICA) 平台在 Nvidia 的加速计算平台上提供 DRAGEN 分析软件。通过整合各自的技术，两家公司的目标是将 DRAGEN 和 Illumina 多组学分析的覆盖范围扩大到全球范围内用户访问 Nvidia 计算平台的地方。

– NVIDIA 在构建 GPU 作为加速平台方面取得了巨大成功，并且他们拥有广泛的资产分布。在不断增长的人工智能需求的推动下，他们到处都有 GPU。我们将共同努力，确保我们也可以在 GPU 上运行 DRAGEN。”Illumina 全球软件和信息学主管 Rami Mehio 说道。一代边缘。

梅希奥说，这项工作已经进行了一年，进展非常顺利，但还需要一些额外的时间才能完成。

“我们的代码相当大，基本上以有效的方式将其全部移植到 GPU 上需要时间，”Mehio 解释道。– Nvidia 和我们这两个团队一直在共同努力。今天我们确实有原型在运行，但它们还没有达到生产质量。我们仍在添加功能并消除错误。”

“我预计我们将在今年年底之前推出一些可用的产品，”Mehio 补充道。

将 DRAGEN 引入 Illumina Connected Analytics 有助于 Nvidia 与几个未公开的国家合作制定国家主权人工智能战略。

– 真正独特的机会 –

– 他们希望保护其人口数据，但同时也希望创造条件，使他们能够拥有世界一流的卫生系统。因此，通过将 DRAGEN 引入 GPU 上的 Illumina 平台，我们获得了一个非常独特的机会。”Nvidia 医疗保健和生命科学副总裁 Kimberly Powell 说道。GEN 边缘。—我们将有能力真正将所有这些令人惊叹的基因组学能力带入这些主权人工智能项目中，并让他们在这些国家拥有最先进的基因组学能力。”

Nvidia 和 Illumina 还同意合作使用 Illumina Connected Analytics 推进多组学数据分析，此外还开发新的生物学基础模型，并计划将 Nvidia 的图像处理和单细胞三级分析工具纳入 Illumina Connected软件多组学模块。

两家公司表示，他们的研究人员还将致力于通过 Illumina Connected Analytics 整合一系列 Nvidia 技术，包括NVIDIA RAPIDS™加速数据科学软件包含在NVIDIA 人工智能企业软件平台；到NVIDIA BioNeMo™用于药物发现的生成式人工智能平台，包括生成式人工智能模型和专有数据集的微调功能；和英伟达莫奈空间细胞成像工作流程框架。

– 通过将它们引入互联分析平台，我们基本上能够将基因组学生态系统大幅扩展和发展到研究界等地方，进入药物发现等地方，希望进入地球上的每个诊所，因为我们正在从仅仅读取人类基因组转向我们可以从这个人类基因组中收集什么样的见解，”鲍威尔说。

“越来越多的行业人士迫切希望更多地了解生物学和疾病，并利用这些工具来寻找新药物或提出更好的治疗策略，”鲍威尔详细阐述。– 挑战在于，整个人类基因组还不是人类可读的。它必须是机器可读的。然后，您希望继续从这些数据中获得见解。我们确实已经到了必须开始以更严肃的方式应用机器学习和人工智能的时候了。”

拜访黄仁勋

Illumina 的 Mehio 表示，合作始于去年的摩根大通医疗保健会议期间，正好一年前，当时他与 Illumina 新任命的首席执行官 Jacob Thaysen 博士会面了 Nvidia 创始人兼首席执行官 Jensen Huang在他家。

“这开启了我们移植 DRAGEN 的初步工作，同时也着眼于我们想要共同探索的生物基础模型，它们确实拥有未来的希望，”Mehio 回忆道。

两家公司在开始合作时遵循了两条轨道。其中之一是如何通过 DRAGEN 利用 GPU 的可用性。“我们主要讨论的第二部分是 Nvidia 和世界如何处于人工智能革命之中，而基因组学将从中受益，”Mehio 说。

– 我们的第一步尝试基本上是将 Nvidia 的人工智能和计算能力引入我们的数据平台 Illumina Connected Analytics，并用我们自己的人工智能工作和分析对其进行补充，以推动这一新领域的发展生物学等的基础模型，”Mehio 总结道。– 所以，这次合作有两件作品。我们在第一个目标上已经取得了很大进展，而在第二个目标上我们正处于初始阶段。”

Illumina 首席执行官 Thaysen 周一晚上在 Nvidia 首席执行官主持的非正式“炉边谈话”中告诉黄仁勋，这些公司的努力预计将产生的多模式人工智能模型可以揭示见解并简化流程，从而提高人类专家的能力。旧金山费尔蒙酒店，位于摩根大通会议举办地以北约半英里的丘陵地带。

——泰森观察到，结合其他信息、其他模式、其他“组学”，将使我们对生物学有更深入的了解。但是，虽然 DNA 本身非常困难，但当你将所有组学结合起来时，它的挑战性就会呈指数级增长。它变得如此复杂，我们确实需要强大的计算能力和人工智能来真正理解和处理它。”

两家公司表示，他们的合作旨在进一步扩大全球基因组学市场（Precedence Research 去年在 12 月 31 日发布的报告中预计该市场将达到 379.4 亿美元），并帮助在确定目标、开发临床阶段药物和发现生物标志物方面取得突破。。

继续推动

“有很多理由继续推动降低成本和提高速度的能力，引入人工智能等新方法，并真正扩大市场，”鲍威尔说。

应对 43^RD周一，摩根大通年度医疗保健会议上，鲍威尔提供了有关合作和合并产品的潜在客户的更多细节。

– 我们将共同努力在 Illumina Connected Analytics 中构建新的应用程序，带来基因组学基础模型，带来非常非常大规模的实时单细胞应用程序，并将基因组的可访问性和实用性扩展到新市场如药物发现，”鲍威尔说。

– 关于生物学的基本组成部分，我们还有很多东西需要了解。这是 Illumina 生成的令人惊叹的数据，现在我们将共同努力构建这些工具，构建这些功能，并将基因组学市场扩展到下一代，扩展到生成 AI 基因组学，以及所有使其更容易被研究界、生物制药和生物技术界使用，甚至将其扩展到临床和研究临床应用，”鲍威尔补充道。

Illumina 首席技术官 Steven Barnard 博士告诉我们一代边缘Nvidia 的合作与其公司未来技术战略的三大支柱方法相吻合。第一支柱需要继续提供市场领先的仪器和测序。第二支柱，将 Illumina 的内容产品扩展到多组学，正如首席执行官 Jacob Thaysen 博士在一份报告中所阐述的那样最近的根面试。

巴纳德阐述道，第三支柱“本质上是成为所有这些生物数据事实上的洞察和解释引擎的能力。”

“除了硬件之上的软件之外，拥有最好的工具和最好的技术来支持第三个支柱也极其重要，”Barnard 补充道，他于 1998 年加入 Illumina，成为该公司的第一任员工。科学家和第四名员工。

IQVIA、梅奥诊所和 Arc 研究所

与 Illumina 的合作是 Nvidia 今天宣布的四项合作伙伴关系之一。另外三个是：

• IQVIA– 这家为生命科学和医疗保健公司提供临床研究服务、商业洞察和医疗保健情报的全球提供商计划使用 NVIDIA AI Foundry 服务，以其超过 64 PB 的信息及其深层领域构建自定义基础模型专业知识。IQVIA 还在开发代理 AI 解决方案（配备 NVIDIA NIM™ 微服务和 NVIDIA 蓝图），旨在加快研究、临床开发和新疗法的获取。

• 梅奥诊所– 全球最大的综合性非营利医疗集团与 Nvidia 合作，表示他们将“大规模”加速下一代病理学基础模型的开发，作为“基石”未来人工智能在药物发现以及个性化诊断和治疗中的应用。Mayo Clinic 计划部署基于 NVIDIA Blackwell 架构的新推出的 NVIDIA DGX™ B200 系统，每个系统提供 1.4TB GPU 内存，以及 Nvidia 的 MONAI 医疗成像平台。
• 电弧研究所– 位于加利福尼亚州帕洛阿尔托的生物学/机器学习研究组织将与 Nvidia 合作开发和共享旨在推进生物医学发现的人工智能模型和工具。Arc 研究人员和 Nvidia 工程师将扩大旨在推广 DNA、RNA 和蛋白质药物模式的生物学基础模型，以及跨复杂性尺度、疾病和进化研究的药物发现和合成生物学的高级应用。Nvidia 表示，它为 Arc 提供了大规模模型开发方面的专业知识，以及在 NVIDIA DGX™ 云上运行的 NVIDIA BioNeMo 平台，该平台专为易于使用、优化的训练而设计；以及 NVIDIA NIM 微服务和蓝图。