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人工智能从头开始加速电化学接口的分子动力学数据集

2025-06-13 11:02:35 英文原文

作者：Cheng, Jun

参考

  1. Wang，R.，Klein，M。L.，Carnevale，V。＆Borguet，E。通过分子动力学模拟对水/氧化物界面进行研究。Wiley跨学科评论：计算分子科学 11，，，，https://doi.org/10.1002/wcms.1537（2021）。

  2. Jeanmairet，G.，Rotenberg，B。＆Salanne，M。电化学双层电容器的微观模拟。化学评论 122，10860年10898，https://doi.org/10.1021/acs.chemrev.1c00925（2022）。

    文章一个 CAS一个 PubMed一个 PubMed Central一个 Google Scholar一个 

  3. Bjã¶rneholm，O。等。界面的水。化学评论 116，7698 7726，https://doi.org/10.1021/acs.chemrev.6b00045（2016）。

    文章一个 CAS一个 PubMed一个 Google Scholar一个 

  4. Sivula，K。＆Krol，R。v。d。光电化学能转化的半导体材料。自然评论材料 1，15010，https://doi.org/10.1038/natrevmats.2015.10（2016）。

    文章一个 广告一个 CAS一个 Google Scholar一个 

  5. Fenter，P。＆Sturchio，N。C.矿物 - 水界面结构，通过同步加速器X射线散射显示。表面科学进展 77，171 258（2004）。

    文章一个 广告一个 CAS一个 Google Scholar一个 

  6. Al-Abadleh，H。A。＆Grassian，V。氧化铝表面上的水吸附的FT-IR研究。Langmuir 19，341 347（2003）。

    文章一个 CAS一个 Google Scholar一个 

  7. Xu，J.，Chen，M.，Zhang，C。＆Wu，X。从系统改进的H键网络描述中对液态水中红外光谱的第一原理研究。物理评论b 99，205123（2019）。

    文章一个 广告一个 CAS一个 Google Scholar一个 

  8. 李，C.-y。等。原位探测原子平坦表面的电气界面水结构。自然材料 18，697 - 701，https://doi.org/10.1038/s41563-019-0356-x（2019）。

    文章一个 广告一个 CAS一个 PubMed一个 Google Scholar一个 

  9. Perakis，F。等。振动光谱和水的动力学。化学评论 116，7590â7607（2016）。

    文章一个 CAS一个 PubMed一个 Google Scholar一个 

  10. Andrade，M。F. C.，Ko，H.-Y.，Zhang，L。，Car，R。＆Selloni，A。质子转移的自由能2接口来自从头开始深度潜在的分子动力学。化学科学 11，2335 2341，https://doi.org/10.1039/c9sc05116c（2020）。

    文章一个 CAS一个 Google Scholar一个 

  11. Guo，Z.，Ambrosio，F.，Chen，W.，Gono，P。＆Pasquarello，A。半导体 - 水接口处的氧化还原水平对齐。材料化学 30，94 111，https://doi.org/10.1021/acs.chemmater.7b02619（2018）。

    文章一个 CAS一个 Google Scholar一个 

  12. Fan，X.-T.，Wen，X.-J.，Zhuang，Y.-B。＆Cheng，J。使用机器学习加速分子动力学对差距（110） - 水接口的分子见解。能源化学杂志 82，239 247，https://doi.org/10.1016/j.jechem.2023.03.013（2023）。

    文章一个 CAS一个 Google Scholar一个 

  13. Hu，J.-Y.，Zhuang，Y.-B。＆Cheng，J。COO（100） - 水和COO（111） - 通过机器学习潜力加速的水接口。化学物理学杂志 161，134110，https://doi.org/10.1063/5.0224137（2024）。

    文章一个 CAS一个 PubMed一个 Google Scholar一个 

  14. Deringer，V。L.等。材料和分子的高斯过程回归。化学评论 121，10073年10141，https://doi.org/10.1021/acs.chemrev.1c00022（2021）。

    文章一个 CAS一个 PubMed一个 PubMed Central一个 Google Scholar一个 

  15. Behler，J。高维神经网络电位的四代。化学评论 121，10037 - 10072，https://doi.org/10.1021/acs.chemrev.0c00868（2021）。

    文章一个 CAS一个 PubMed一个 Google Scholar一个 

  16. Wen，T.，Zhang，L.，Wang，H.，Weinan，E。＆Srolovitz，D。J.材料科学的深度潜力。材料期货 1，022601（2022）。

    文章一个 CAS一个 Google Scholar一个 

  17. Zhuang，Y.-B。电脑，https://doi.org/10.12463/ai4ec/8npzzc（2024）。

  18. Zhu，J.-X.，Cheng，J。＆Doblhoff-Dier，K。Pt（111）/水接口处的介电轮廓。化学物理学杂志 162，024702，https://doi.org/10.1063/5.0239284（2025）。

    文章一个 CAS一个 PubMed一个 Google Scholar一个 

  19. 贾，M.2（110）/h2o接口从头开始深度潜在的分子动力学。精确化学（2024）。

  20. Zhuang，Y.-B.，Bi，R.-H。＆Cheng，J。解决金红石Tio的奇数振荡水解离的振荡2（110） - 通过机器学习加速分子动力学的水接口。化学物理学杂志 157，164701，https://doi.org/10.1063/5.0126333（2022）。

    文章一个 广告一个 CAS一个 PubMed一个 Google Scholar一个 

  21. Zhuang，Y.-B。＆Cheng，J。在金红石（110） - 水界面上解密了末端水的异常酸性趋势。物理化学杂志c 127，10532â10540，https://doi.org/10.1021/acs.jpcc.3c01870（2023）。

    文章一个 CAS一个 Google Scholar一个 

  22. 李，X.-y。等。金属/水接口的水吸附能与伏尔泰电位差之间的线性相关性。物理化学杂志 12，7299 7304，https://doi.org/10.1021/acs.jpclett.1c02001（2021）。

    文章一个 CAS一个 PubMed一个 Google Scholar一个 

  23. Zeng，Z。等。原始低指数TIO的水解离的机械洞察力2来自机器学习分子动力学模拟的表面。自然通讯 14，6131，https://doi.org/10.1038/s41467-023-41865-8（2023）。

    文章一个 广告一个 CAS一个 PubMed一个 PubMed Central一个 Google Scholar一个 

  24. Martãnez，L。，Andrade，R.，Birgin，E。G.＆Martãnez，J。M. Packmol：用于构建用于分子动力学模拟的初始配置的包装。计算化学杂志 30，2157 A2164（2009）。

    文章一个 PubMed一个 Google Scholar一个 

  25. Berendsen，H。J.，Grigera，J.-R。＆Straatsma，T。P.有效对电势的缺失项。物理化学杂志 91，6269 - 6271（1987）。

    文章一个 CAS一个 Google Scholar一个 

  26. Kã¼hne，T。D.等。CP2K：电子结构和分子动力学软件包 - 快速步骤：有效，准确的电子结构计算。化学物理学杂志 152，194103，https://doi.org/10.1063/5.0007045（2020）。

    文章一个 广告一个 CAS一个 PubMed一个 Google Scholar一个 

  27. Perdew，J。P.，Burke，K。＆Ernzerhof，M。通用梯度近似变得简单。物理评论信 77，3865 3868，https://doi.org/10.1103/physrevlett.77.3865（1996）。

    文章一个 广告一个 CAS一个 PubMed一个 Google Scholar一个 

  28. Grimme，S.，Antony，J.，Ehrlich，S。＆Krieg，H。一致且准确的从头开始94个元素H-PU的密度功能色散校正（DFT-D）的参数化。化学物理学杂志 132，154104，https://doi.org/10.1063/1.3382344（2010）。

    文章一个 广告一个 CAS一个 PubMed一个 Google Scholar一个 

  29. Vandevondele，J。和Hutter，J。高斯基础设置，用于对气体和冷凝相分子系统的准确计算。化学物理学杂志 127，114105，https://doi.org/10.1063/1.2770708（2007）。

    文章一个 广告一个 CAS一个 PubMed一个 Google Scholar一个 

  30. Lippert，G.，Hutter，J。＆Parrinello，M。杂交高斯和平面波密度功能方案。分子物理学 92，477年487，https://doi.org/10.1080/00268979709482119（1997）。

    文章一个 广告一个 CAS一个 Google Scholar一个 

  31. Goedecker，S.，Teter，M。＆Hutter，J。可分离的双空间高斯假脉。物理评论b 54，1703年1710年，https://doi.org/10.1103/physrevb.54.1703（1996）。

    文章一个 广告一个 CAS一个 Google Scholar一个 

  32. Vandevondele，J。和Hutter，J。一种用于电子结构计算的有效轨道转化方法。化学物理学杂志 118，4365 - 4369，https://doi.org/10.1063/1.1543154（2003）。

    文章一个 广告一个 CAS一个 Google Scholar一个 

  33. Kã¼hne，T。D.，Krack，M.，Mohamed，F。R.＆Parrinello，M。对Born-Oppenheimer分子动力学的有效且准确的类似Car-Parrinello的方法。物理评论信 98，066401，https://doi.org/10.1103/physrevlett.98.066401（2007）。

    文章一个 广告一个 PubMed一个 Google Scholar一个 

  34. Nosâ©，S。恒定温度分子动力学方法的统一公式。化学物理学杂志 81，511 519，https://doi.org/10.1063/1.447334（1984）。

    文章一个 广告一个 Google Scholar一个 

  35. Nosâ©，S。一种用于模拟的分子动力学方法。分子物理学 52，255 268，https://doi.org/10.1080/00268978400101201（1984）。

    文章一个 广告一个 Google Scholar一个 

  36. Vandevondele，J。等。温度和密度功能模型在从头开始分子动力学模拟液态水。化学物理学杂志 122，014515，https://doi.org/10.1063/1.1828433（2005）。

    文章一个 广告一个 CAS一个 Google Scholar一个 

  37. 汤普森，A。P。等。LAMMPS-一种在原子，中索和连续体尺度上用于粒子材料建模的灵活仿真工具。comp。物理。通讯。 271，108171，https://doi.org/10.1016/j.cpc.2021.108171（2022）。

    文章一个 CAS一个 Google Scholar一个 

  38. Wang，H.，Zhang，L.，Han，J。＆E，W。DeepMd-Kit：用于多体势能表示和分子动力学的深度学习包。计算机物理通信 228，178 - 184，https://doi.org/10.1016/j.cpc.2018.03.016（2018）。

    文章一个 广告一个 CAS一个 Google Scholar一个 

  39. 张，L。等。有限和扩展系统的端到端对称性保留原子间势能模型。在班吉奥，S。等。（ed。）神经信息处理系统的进步，卷。31（Curran Associates，Inc.，2018年）。

  40. Zeng，J。等。DEEPMD-KIT V2：用于深度潜在模型的软件包。化学物理学杂志 159，054801，https://doi.org/10.1063/5.0155600（2023）。

    文章一个 广告一个 CAS一个 PubMed一个 PubMed Central一个 Google Scholar一个 

  41. Zhang，L.，Lin，D.-Y.，Wang，H.，Car，R。＆E，W。均匀准确的材料模拟的原子间潜力的主动学习。物理评论材料 3，023804，https://doi.org/10.1103/physrevmaterials.3.023804（2019）。

    文章一个 广告一个 CAS一个 Google Scholar一个 

  42. 张，Y。等。DP-gen：一个并发学习平台，用于生成可靠的基于深度学习的势能模型。计算机物理通信 253，107206，https://doi.org/10.1016/j.cpc.2020.107206（2020）。

    文章一个 MathScinet一个 CAS一个 Google Scholar一个 

  43. Michaud-Agrawal，N.，Denning，E。J.，Woolf，T。B.＆Beckstein，O。Mdanalysis：用于分析分子动力学模拟的工具包。计算化学杂志 32，2319 2327，https://doi.org/10.1002/jcc.21787（2011）。

    文章一个 CAS一个 PubMed一个 PubMed Central一个 Google Scholar一个 

  44. Cheng，J。＆Sprik，M。Tio的电子能级对齐2/h2o接口。物理评论b 82，081406，https://doi.org/10.1103/physrevb.82.081406（2010）。

    文章一个 广告一个 Google Scholar一个 

  45. Cheng，J。＆Sprik，M。电化学界面上电子能级的对齐。物理化学物理学 14，11245 - 11267，https://doi.org/10.1039/c2cp41652b（2012年）。

    文章一个 CAS一个 PubMed一个 Google Scholar一个 

  46. Jia，M.，Zhang，C.，Cox，S.J.，Sprik，M。＆Cheng，J。来自密度基于功能理论的分子动力学的质子跳组的表面酸度常数：应用于SNO2（110）/h2o接口。化学理论与计算杂志 16，6520 6527，https://doi.org/10.1021/acs.jctc.0c00021（2020）。

    文章一个 CAS一个 PubMed一个 Google Scholar一个 

  47. Zhuang，Y.-B。＆Cheng，J。使用金属/氧化物 - 水界面的带对齐从头开始分子动力学。电化学杂志 https://doi.org/10.13208/j.electrochem.2216001（2022）。

  48. Li，J.-Q.，Sun，Y。＆Cheng，J。水氧化酶TiO的水吸附构象的理论研究2/水接口。材料化学杂志 11，943 - 952，https://doi.org/10.1039/d2ta07994a（2022）。

    文章一个 CAS一个 Google Scholar一个 

  49. Li，J.-Q.，Hu，J.-Y.＆Cheng，J。对解剖酶Tio的带边缘的水效应2表面：一项关于跨表面异质结和方面依赖的光效率的电荷迁移的理论研究。物理化学物理学 25，29143 29154，https://doi.org/10.1039/d3cp03662f（2023）。

    文章一个 CAS一个 PubMed一个 Google Scholar一个 

  50. 安德拉德2。物理化学杂志 9，6716年6721，https://doi.org/10.1021/acs.jpclett.8b03103（2018）。

    文章一个 CAS一个 Google Scholar一个 

  51. Raman，A。S.＆Selloni，A。模型IRO的酸碱化学2催化界面。物理化学杂志 14，7787 7794，https://doi.org/10.1021/acs.jpclett.3c02001（2023）。

    文章一个 CAS一个 PubMed一个 Google Scholar一个 

  52. Kharche，N.，Muckerman，J。T.＆Hybertsen，M。S.第一原理的方法来计算水位半导体接口处的能级对齐。物理评论信 113，176802，https://doi.org/10.1103/physrevlett.113.176802（2014）。

    文章一个 广告一个 PubMed一个 Google Scholar一个 

  53. Ambrosio，F.，Wiktor，J。＆Pasquarello，A。pH依赖性催化反应途径，用于Bivo的水分裂4 - 从带对齐的水接口。ACS能量信 3，829 - 834，https://doi.org/10.1021/acsenergylett.8b00104（2018）。

    文章一个 CAS一个 Google Scholar一个 

  54. Ambrosio，F.，Wiktor，J。＆Pasquarello，A。第一原理pH依赖性表面化学：应用于Bivo4（010） - 水接口。ACS应用材料和界面 10，10011 10021，https://doi.org/10.1021/acsami.7b16545（2018）。

    文章一个 CAS一个 Google Scholar一个 

  55. Quaranta，V。，Hellstrãm，M。＆Behler，J。Water-Zno界面的质子转移机制：预设的作用。物理化学杂志 8，1476年1483年，https://doi.org/10.1021/acs.jpclett.7b00358（2017）。

    文章一个 CAS一个 PubMed一个 Google Scholar一个 

  56. Quaranta，V。等。从高维神经网络电位上的水/ZnO（10ä«0）界面的最大解析的Anharmonic OH振动光谱。化学物理学杂志 148，241720，https://doi.org/10.1063/1.5012980（2018）。

    文章一个 广告一个 CAS一个 PubMed一个 Google Scholar一个 

  57. Quaranta，V。，Behler，J。＆Hellstrãm，M。机器学习潜在模拟的液体水/锌 - 氧化物接口的结构和动力学。物理化学杂志c 123，1293年1304年，https://doi.org/10.1021/acs.jpcc.8b10781（2019）。

    文章一个 CAS一个 Google Scholar一个 

  58. Hellstrã¶m，M.，Quaranta，V。＆Behler，J。一维与二维质子运输过程在固体锌 - 氧化物 - 氧化物水接口处。化学科学 10，1232â1243，https://doi.org/10.1039/c8sc03033b（2018）。

    文章一个 CAS一个 PubMed一个 PubMed Central一个 Google Scholar一个 

  59. Tocci，G。和Michaelides，A。在水氧化物界面上溶剂引起的质子跳。物理化学杂志 5，474 480，https://doi.org/10.1021/jz402646c（2014）。

    文章一个 CAS一个 PubMed一个 PubMed Central一个 Google Scholar一个 

  60. Liu，L.-M。，Zhang，C.，Thornton，G。＆Michaelides，A。液体水的结构和动力学2（110）。物理评论b 82，161415，https://doi.org/10.1103/physrevb.82.161415（2010）。

    文章一个 广告一个 Google Scholar一个 

  61. Le，J.，Iannuzzi，M.，Cuesta，A。＆Cheng，J。从基于密度功能的分子动力学中，金属电极零电荷与标准氢电极的零电势。物理评论信 119，016801，https://doi.org/10.1103/physrevlett.119.016801（2017）。

    文章一个 广告一个 CAS一个 PubMed一个 Google Scholar一个 

  62. Le，J.，Fan，Q.，Perez-Martinez，L.，Cuesta，A。＆Cheng，J。基于密度功能理论的分子动力学，对金属水接口的振动光谱的理论见解。物理化学物理学 20，11554年11558，https://doi.org/10.1039/c8cp00615f（2018）。

    文章一个 CAS一个 PubMed一个 Google Scholar一个 

  63. Le，J.-B。等。对电气化的PT（111）-HAD/水接口建模从头开始分子动力学。Jacs au 1，569 - 577，https://doi.org/10.1021/jacsau.1c00108（2021）。

    文章一个 CAS一个 PubMed一个 PubMed Central一个 Google Scholar一个 

  64. Le，J.-B.，Yang，X.-H.，Zhuang，Y.-B.，Jia，M。＆Cheng，J。从头开始电催化的建模。物理化学杂志 12，8924年8931年，https://doi.org/10.1021/acs.jpclett.1c02086（2021）。

    文章一个 CAS一个 PubMed一个 Google Scholar一个 

  65. 陈，A.从头开始分子动力学。化学物理学杂志 157，094702，https://doi.org/10.1063/5.0100678（2022）。

    文章一个 广告一个 CAS一个 PubMed一个 Google Scholar一个 

  66. Li，L.，Liu，Y.-P.，Le，J.-B。＆Cheng，J。金属水界面上电的双层分子结构和离子效应。细胞报告物理科学 3，100759，https://doi.org/10.1016/j.xcrp.2022.100759（2022）。

    文章一个 CAS一个 Google Scholar一个 

  67. Zhu，J.-X.，Le，J.-B.，Koper，M.T。M.，Doblhoff-Dier，K。＆Cheng，J。吸附OH对PT（100）/水界面结构和潜力的影响。物理化学杂志c 125，21571 21579，https://doi.org/10.1021/acs.jpcc.1c04895（2021）。

    文章一个 CAS一个 Google Scholar一个 

  68. Natarajan，S。K.和Behler，J。固液界面的神经网络分子动力学模拟：低索引铜面的水。物理化学物理学 18，28704 28725，https://doi.org/10.1039/c6cp05711j（2016）。

    文章一个 CAS一个 PubMed一个 Google Scholar一个 

  69. Natarajan，S。K.和Behler，J。铜水接口处的表面缺陷的自扩散。物理化学杂志c 121，4368年4383，https://doi.org/10.1021/acs.jpcc.6b12657（2017）。

    文章一个 CAS一个 Google Scholar一个 

  70. 卡拉斯科（J.自然材料 11，667 - 674，https://doi.org/10.1038/nmat3354（2012年）。

    文章一个 广告一个 CAS一个 PubMed一个 Google Scholar一个 

  71. Wen，X.，Fan，X.-T.，Jin，X。＆Cheng，J。2D材料 - 水接口的带对齐方式。物理化学杂志c 127，4132â4143，https://doi.org/10.1021/acs.jpcc.3c00220（2023）。

    文章一个 CAS一个 Google Scholar一个 

  72. Li，L。，Andrade，M。F. C.，Car，R.，Selloni，A。＆Carter，E。A.表征结构依赖性TIS2/使用深神经网络辅助分子动力学的水接口。物理化学杂志c 127，9750 9758，https://doi.org/10.1021/acs.jpcc.2c08581（2023）。

    文章一个 CAS一个 Google Scholar一个 

  73. Fan，X.-T.，Jia，M.，Lee，M.-H。＆Cheng，J。水对间隙带对对齐的影响：对吡啶菌催化二氧化碳减少的理论洞察力。能源化学杂志 26，724 - 729，https://doi.org/10.1016/j.jechem.2017.03.002（2017）。

    文章一个 Google Scholar一个 

  74. Fan，X.-T.，Wen，X.-J。＆Cheng，J。在吡啶辅助CO中对齐电子能级2使用间隙（110）/水接口激活从头开始分子动力学。ACS催化12521年12529，https://doi.org/10.1021/acscatal.2c04121（2022）。

  75. Yan，S.，Wang，B。＆Lin，H。在散装水中跟踪质子的质子转移中的DELACALIGET质子。化学理论与计算杂志 19，448 A459（2023）。

    文章一个 CAS一个 Google Scholar一个 

  76. McGibbon，R。T.等。MDTRAJ：一个现代开放库，用于分析分子动力学轨迹。生物物理杂志 109，1528年1532年，https://doi.org/10.1016/j.bpj.2015.08.015（2015）。

    文章一个 广告一个 CAS一个 PubMed一个 PubMed Central一个 Google Scholar一个 

  77. Humphrey，W.，Dalke，A。＆Schulten，K。VMD：视觉分子动力学。分子图形杂志 14，33 38，https://doi.org/10.1016/0263-7855(96)00018-5（1996）。

    文章一个 CAS一个 PubMed一个 Google Scholar一个 

  78. Momma，K。＆Izumi，F。Vesta 3，用于晶体，体积和形态数据的三维可视化。应用晶体学杂志 44，1272年1276年，https://doi.org/10.1107/s0021889811038970（2011）。

    文章一个 广告一个 CAS一个 Google Scholar一个 

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提供的文本是与分子动力学有关的研究论文的全面参考列表或书目，尤其是针对各种固体界面和电催化的水的行为。它包括该领域的几位著名研究人员的作品，例如J.-B.。Le，A。Cheng，M.T.M。Koper，E.A。Carter，R。Car，S.K。Natarajan，J。Behler等。参考文献涵盖了广泛的主题，包括：1。**从头算分子动力学**：J.-B。类似的论文。Le等人，使用从头算分子动力学（AIMD）探索界面，以了解金属表面或电催化场景中水的行为。2。**深度神经网络和机器学习**：诸如Li等人的研究。使用深神经网络辅助分子动力学来模拟和分析复杂系统。3。**质子转移动力学**：像Yan等人的作品这样的研究深入研究了质子在散装水中或界面中的机理，这是理解催化过程的关键方面。4。**电子带对齐**：Wen等人等论文。研究分子和添加剂如何影响半导体 - 水接口处的电子带对齐，这对于能量转换和存储应用至关重要。5。**可视化工具**：该列表还包括对用于分析和可视化分子动力学轨迹的MDTRAJ和VMD等软件工具的引用，并协助研究人员有效地解释其仿真结果。6。**电催化建模**：几篇论文讨论了使用AIMD在各种金属水接口上对电催化反应进行建模的进步。7。**表面上的水结构动力学**：像Carrasco等人一样的工作，专注于理解吸附在金属表面上的水层的结构和动力学，从而影响腐蚀保护和催化剂设计等领域。每个参考指向在信誉良好的期刊上发表的特定研究文章或评论，为分子模拟技术及其应用的最新发展和挑战提供了见解。该汇编不仅可以作为参考书目，而且还可以作为在材料科学和化学领域从事类似主题的研究人员之间进行进一步研究和协作的指南。

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