作者:Chen, Xiaoyuan
陈H., 张W., 朱G., 谢J. 和 陈X. 重新思考癌症纳米治疗诊断学。自然·材料 2, 17024 (2017).
施杰,Kantoff PW,沃斯特R,Farokhzad OC. 癌症纳米医学:进展、挑战与机遇。自然·癌症综述 17, 20–37 (2017).
阿卜德·埃尔法塔赫,T. 等。微流控纳米等离子放大技术实现了病原体核酸生物标志物的加速比色定量。自然·纳米技术 18, 922–932 (2023).
米切尔等。精确工程纳米颗粒用于药物输送。自然· Reviews·药物发现 20, 101–124 (2021).
侯旭, 扎克斯, T., 拉nger, R. & 冬, Y. 用于mRNA递送的脂质纳米颗粒。自然·材料 6, 1078–1094 (2021).
金,M.等。通过机器学习在血清中利用量子缺陷修饰的碳纳米管光谱指纹识别卵巢癌。自然医学与生物工程杂志 6, 267–275 (2022).
张杰,赵彤,Jakobsson V., 陈旭. 精准肿瘤学放射诊疗的临床转化。自然评论生物工程 1, 612–614 (2023).
方RH,高W,张L. 使用细胞膜包被的纳米颗粒将药物靶向肿瘤。自然综述·临床肿瘤学 20, 33–48 (2023).
李X,Lovell JF,Yoon J及陈X。光热和光动力疗法在癌症临床开发中的进展与潜力。自然·_reviews_临床肿瘤学 17, 657–674 (2020).
拉加拉姆,A.,班斯科塔,S.及刘迪R. 基因编辑剂的治疗性体内递送。细胞 185, 2806–2827 (2022).
南,J. 等人. 结合癌症免疫治疗的癌症纳米医学。自然·材料 4, 398–414 (2019).
赵,H.等.一种用于合成胶体纳米晶体的机器人平台。自然合成 2, 505–514 (2023).
黄X等. 基于纳米技术对抗SARS-CoV-2变异株的策略。自然·纳米技术 17, 1027–1037 (2022).
朴俊植等。一种用于从血浆中快速分析肿瘤外泌体的集成磁电化学设备。自然.生物医学.工程 5, 678–689 (2021).
饶丽等。杂交细胞膜纳米囊泡增强巨噬细胞对癌症复发和转移的免疫反应。自然通讯_nat. commun. 11, 4909 (2020).
巴特勒,K. T., 迈耶斯,D. W., 卡特赖特,H., 伊斯亚耶夫,O. 和 沃尔什,A. 分子和材料科学的机器学习。自然 559, 547–555 (2018).
伦琴,Y.,本吉奥,Y. & 希顿,G. 深度学习。自然 521, 436–444 (2015).
沈,D.,吴,G.及Suk,H.-I. 医学图像分析中的深度学习。生物医学工程年度评论 19, 221–248 (2017).
卡马乔,D. M., 科林斯,K. M., 波wers,R. K., 科斯特洛,J. C. & 科林斯,J. J. 生物网络的下一代机器学习。细胞 173, 1581–1592 (2018).
余凯汉,贝姆A.L. & 科罕I.S. 医疗领域的 artificial intelligence(人工智能)自然.生物医学.工程 2, 719–731 (2018).
Jumper, J. 等人。使用 AlphaFold 进行高精度蛋白质结构预测。自然 596, 583–589 (2021).
塞格勒,M. H. S.,普鲁斯,M. & 墙尔,M. P. 使用深度神经网络和符号人工智能规划化学合成。自然 555, 604–610 (2018).
Ziatdinov, M., Ghosh, A., Wong, C. Y. & Kalinin, S. V. 原子AI框架:用于电子显微镜和扫描探针显微镜图像及光谱数据分析的深度学习方法。自然机器智能 4, 1101–1112 (2022).
海因茨曼,K.,卡特,L. M.,刘易斯,J. S.及阿博伊杰,E. O. 多重成像技术在诊断和治疗中的应用。自然医学与生物工程杂志 1, 697–713 (2017).
阿科斯塔,J. N., 法尔孔,G. J., 拉贾普卡尔,P. & 托波尔,E. J. 多模态生物医学AI。自然医学杂志 28, 1773–1784 (2022).
黄凤(F.), de la Fuente-Nunez, C.及Collins, J. J. 利用人工智能对抗传染病。科学 381, 164–170 (2023).
布雷曼,L. 随机森林。机器学习 45, 5–32 (2001).
纪伟, H. & 志仁, L. 多类支持向量机方法的比较。IEEE Transactions on Neural Networks 13, 415–425 (2002).
沃尔德,S.,施约斯特隆,M. & 埃里克松,L. 偏最小二乘回归:化学计量学的基本工具。化学计量学与智能实验室系统 58, 109–130 (2001).
马松, J.-F., 贝京斯, J. S. & 瑞因格, E. 纳米等离子学的机器学习。自然·纳米技术 18, 111–123 (2023).
万芳,黄福,科林斯JJ,德拉富恩特-努涅斯C. 抗微生物肽识别与设计的机器学习方法。自然综述·生物工程 2, 392–407 (2024).
马赫穆迪,M.,兰德里,M. P.,摩尔,A. & 科雷亚斯,R. 从纳米医学到环境科学的蛋白冠。自然·材料 8, 422–438 (2023).
陶, H. 等人. 机器学习辅助的纳米颗粒合成。自然·材料 6, 701–716 (2021).
戴旭, 陈颖. 计算生物材料:生物医学的计算模拟。先进材料 35, 2204798 (2023).
Merchant, A.等人. 将深度学习扩展应用于材料发现。自然 624, 80–85 (2023).
巴特拉,R. 等。机器学习克服了人类偏见,在自我组装肽的发现中取得进展。自然·化学 14, 1427–1435 (2022).
朱,M.等。机器学习辅助的单血管纳米颗粒通透性分析在肿瘤血管中的研究。自然·纳米技术 18, 657–666 (2023).
博恩克,N. 等人。大规模平行池筛查揭示纳米粒子递送的基因组决定因素。科学 377吴斌5551(2022).
Yamankurt, G. 等人. 利用高通量筛选和机器学习探索纳米医学设计空间。自然.生物医学.工程 3, 318–327 (2019).
沙玛伊,Y. 等。定量自组装预测产生靶向纳米药物。自然材料 17, 361–368 (2018).
斯特勒尔,E. P., 儒纳伊,A. Y., 哈特,C. & 格里姆,J. 纳米粒子的辅助效应及其对纳米医学的影响。自然·纳米技术 16, 1180–1194 (2021).
吕,Y., Aimetti, A. A., Langer, R. & 郭,Z. 生物响应材料。自然·材料 1, 16075 (2016).
洪, G., 燕, S., 安塔里斯, A. L. & 戴, H. 用于生物成像和纳米医药治疗的碳纳米材料。化学评论 115, 10816–10906 (2015).
苏瓦尔迪,A.等. 机器学习驱动的生物材料进化。先进材料 34, 2102703 (2022).
Rycenga, M. 等人。控制银纳米结构的合成与组装以应用于等离子体学。化学评论 111, 3669–3712 (2011).
杨,X., 杨,M., 盛,B., 瓦拉,M. & 夏,Y. 生物医学中的金纳米材料的应用。化学评论 115, 10410–10488 (2015).
Michalet, X. 等人. 量子点在活细胞、体内成像和诊断中的应用。科学 307, 538–544 (2005).
金, P. 等人. 利用机器学习方法量化磁性纳米粒子在MRI和超热疗应用中的有效性。小的 19, 2303522 (2023).
塞罗夫,N. & 维诺格拉多夫,V. 人工智能将使纳米医学变为现实。药物递送评论期刊 Advances in Drug Delivery Reviews 184, 114194 (2022).
Gran, J., Auguié, B. & Le Ru, E. C. 结合消光和吸收的紫外-可见光谱法作为揭示金属纳米粒子形状缺陷的方法。分析化学 91, 14639–14648 (2019).
格尔曼,A. M. M. 等人。通过光诱导过程生成参数化金纳米粒子的人工神经网络建模。材料研究快讯 5, 085011 (2018).
沙法伊,A. & 哈亚蒂,G. R. 使用混合人工神经网络-粒子群优化算法预测绿色合成法制备银纳米颗粒尺寸的模型。测量 151, 107199 (2020).
小 moto,Y. 等人。人工神经网络在组合纳米粒子合成中快速数据分析的应用。 注意:“Orimoto”在这里可能是人名,通常情况下不会翻译成中文,但根据要求“确切的翻译”,这里采取音译的方式进行处理。“et al.”表示作者人数较多或未列出所有作者,在中文文献引用中一般直接保留原文形式。J. 物理化学C 116, 17885–17896 (2012).
萨利,D. 等。用于金纳米粒子形状编程达尔文进化的一种纳米材料发现机器人。自然通讯 11, 2771 (2020).
程,Q.等.选择性器官靶向(SORT)纳米粒子用于组织特异性mRNA递送和CRISPR-Cas基因编辑。自然·纳米技术 15, 313–320 (2020).
Ng, K. K. & 郑, G. 用于光诊疗应用的有机纳米粒子中的分子相互作用。化学评论杂志简称(Chem. Rev.) 115, 11012–11042 (2015).
安德鲁斯 N. 等人. COVID-19疫苗针对奥密克戎(B.1.1.529)变异株的有效性。新英氏医学杂志 386, 1532–1546 (2022).
李博等。用于肺部mRNA递送和基因组编辑的纳米颗粒组合设计。自然·生物技术 41, 1410–1415 (2023).
王伟等。利用机器学习算法预测用于mRNA疫苗的脂质纳米颗粒。药学学报B辑 12, 2950–2962 (2022).
Walkey, C. D. & Chan, W. C. W. 理解和控制纳米材料在生理环境中与蛋白质的相互作用。化学学会评论(Chem. Soc. Rev.) 41, 2780–2799 (2012).
优西亚, J., 阿里, M. E. & 兰普雷希特, A. 基于人工神经网络的聚丙烯纳米粒子粒径预测。欧洲药剂学与生物制药杂志 119, 333–342 (2017).
沙拉比,K.S. 等人。使用人工神经网络确定PEG/PLA纳米颗粒中Noscapine的粒径和包封效率的影响因素。国际纳米医学杂志 9, 4953–4964 (2014).
奥格登,P. J.,科尔西克,E. D.,塞纳,S. 和奇尔奇,G. M. 全面的AAV衣壳适应性景观揭示了一个病毒基因并实现了机器引导的设计。科学 366, 1139–1143 (2019).
孟庆芳等。使用iSEND纳米颗粒吸入递送的地塞米松减轻了小鼠和非人灵长类动物中的COVID-19细胞因子风暴。科学进展. 9eadg3277 (2023)
威尔赫姆等。关于纳米颗粒递送至肿瘤的分析。自然·材料 1, 16014 (2016).
赫曼, I. K., 伍德, M. J. A. & 芬鲁曼, G. 细胞外囊泡作为下一代药物递送平台。自然·纳米技术 16, 748–759 (2021).
Madigan, V., 张, F. & Dahlman, J. E. 基于CRISPR的基因编辑工具的药物递送系统。自然·药物发现 22, 875–894 (2023).
卡鲁里,R. & 勒布吕,V. S. 外泌体的生物学、功能和生物医学应用。科学 367,eaau6977 (2020).
曾格尔 J. 等人。通过工程化受体表达在小鼠中硬连线组织特异性AAV转导。自然方法杂志 20, 1070–1081 (2023).
布莱恩特 D.H. 等人。通过机器学习深度开发AAV衣壳蛋白。自然·生物技术 39, 691–696 (2021).
埃尔安达卢西,S.,迈格尔,I.,布雷克菲尔德,X. O. & 伍德,M. J. A. 外泌体:生物学及新兴治疗机会。自然·药物发现评论 12, 347–357 (2013).
郑,W.等.通过光学检测血液样本中外泌体上的两种毒力因子诊断儿童结核病。自然生物医学工程杂志 6, 979–991 (2022).
库普尔斯,S. 等人。基于无监督机器学习的纳米级荧光胞外囊泡聚类。小的 17, 2006786 (2021).
马赫穆迪等。蛋白质-纳米粒子相互作用:机遇与挑战。化学评论 111, 5610–5637 (2011).
Salvati, A. 等人。当生物分子冠吸附在表面时,经过转铁蛋白功能化的纳米粒子会失去其靶向能力。自然·纳米技术 8, 137–143 (2013).
Nel, A. E. 等人. 理解纳米-生物界面的生物物理化学相互作用。自然材料 8, 543–557 (2009).
Kingston, B. R., Syed, A. M., Ngai, J., Sindhwani, S. & Chan, W. C. W. 利用三维显微镜和机器学习评估纳米颗粒针对微小转移灶的目标效果。 Proc. Natl Acad. Sci. USA 116, 14937–14946 (2019).
Ferdosi, S. 等人。工程纳米颗粒通过利用可调的纳米-生物相互作用,实现了大规模深度蛋白质组学研究。 Proc. Natl Acad. Sci. USA 119,e2106053119 (2022).
查, M. 等. 生物和仿生纳米复合材料的结构描述符统一模型。自然计算科学 2, 243–252 (2022).
班, Z. 等人. 机器学习预测蛋白质冠的功能组成及纳米颗粒的细胞识别。 Proc. Natl Acad. Sci. USA 117, 10492–10499 (2020).
欧阿西尔,N.,平纳斯,R. L.,德尔博尼斯-奥'Donnell,J. T.,王,J. W. & 兰德里,M. P. 监督学习模型预测蛋白质吸附到碳纳米管。科学进展 8吴斌敏0898 (2022).
萨尔丁格,J. C., 雷蒙德,M., 埃尔瓦蒂,P. & 维奥利,A. 跨蛋白质和纳米颗粒的纳米尺度相互作用的领域无关预测。自然计算科学 3, 393–402 (2023).
刘瑞,江伟,Walkey CD,Chan WCW及Cohen Y. 基于蛋白冠和物理化学性质预测纳米粒子与细胞的关联。纳米尺度 7, 9664–9675 (2015).
拉扎罗维茨,J. 等。监督学习和质谱预测纳米材料的体内命运。ACS Nano 13, 8023–8034 (2019).
D. Fourches 等人. 定量纳米结构-活性关系模型。ACS Nano 4, 5703–5712 (2010).
贝赫扎迪,S. 等。纳米颗粒的细胞摄取:进入细胞内的旅程。化学学会评论 46, 4218–4244 (2017).
Walkey, C. D. 等人。蛋白质冠指纹预测金纳米粒子和银纳米粒子的细胞相互作用。ACS Nano 8, 2439–2455 (2014).
Löcher, A., Bruyns-Haylett, M., Ballester, P. J., Borros, S. & Oliva, N. 利用机器学习预测pBAE多聚复合物的细胞摄取。生物材料科学 11, 5797–5808 (2023).
Shirokii, N. 等人。通过机器学习定量预测无机纳米材料的细胞毒性。小的 19, 2207106 (2023).
马丁等人. 基于证据的无定形二氧化硅纳米颗粒细胞毒性预测。 ACS纳米(ACS Nano) 17, 9987–9999 (2023).
贾赫沃,S.,塞罗夫,N., Dmitrenko,A. & 文诺格拉多夫,V. V. 巨量靶向发现选择性细胞毒无机纳米粒子的机器学习增强遗传算法。小的 20, 2305375 (2024).
普赞, T. 等人. 使用纳米QSAR预测金属氧化物纳米颗粒的细胞毒性。自然·纳米技术 6, 175–178 (2011).
塞尔丰 R. S. G., 黄 K. A. & 特罗扬斯卡娅 O. G. 利用机器学习方法建模多细胞复杂性和组织特异性。自然综述材料 6, 717–729 (2021).
陈,Q.等.肿瘤携带小鼠中纳米颗粒在肿瘤和主要器官分布的meta分析。 ACS Nano 17, 19810–19831 (2023).
MacMillan, P. 等人. 预测异质性肿瘤组织中纳米颗粒分布的研究。纳米快报 23, 7197–7205 (2023).
刘, X. 等. 生物系统中纳米材料暴露效应的预测建模。国际纳米医学杂志 8, 31–43 (2023).
吉尔伯特森 L. M. 等人。迈向更安全的多壁碳纳米管设计:建立一个统计模型,该模型将表面电荷与胚胎斑马鱼死亡率相关联。纳米毒理学 10, 10–19 (2016).
宋,Y.等.用于机器学习驱动的多模态健康监测的3D打印表贴电子皮肤。科学·进展 9eadi6492 (2023).
林 AA, 尼明奥恩克 V, 伊萨多尔 D & 卡彭特 EL. 基于细胞外囊泡的多分析物液体活检作为癌症诊断工具。生物医学数据科学年鉴 5, 269–292 (2022).
徐,C., 苏利文,S. A. & 高,W. 人工智能驱动的电子皮肤。自然机器智能 5, 1344–1355 (2023).
阿尔图格,H.,奥,S.-H.,迈尔,S. A. &霍莫拉,J. 纳米光子生物传感器的应用与进展。自然·纳米技术 17, 5–16 (2022).
萨菲尔,F. 等人。结合声学生物打印与人工智能辅助拉曼光谱技术实现血液中细菌的高通量识别。纳米快报 23, 2065–2073 (2023).
申,H.等.利用外泌体SERS-AI进行多种癌症类型的早期诊断单次检测方法。自然通讯_nat. commun.(保持原样,因为这是期刊的标准英文缩写) 14, 1644 (2023).
卡万甘格,D. 等人。用于检测神经退行性疾病结构蛋白生物标志物的与人工智能结合的等离子体红外传感器。科学进展 9eadg9644 (2023).
高泽等。利用机器学习辅助的微流控纳米等离子体数字免疫测定法对COVID-19患者细胞因子风暴进行谱型分析。ACS Nano 15, 18023–18036 (2021).
W. J. Thrift 等人。利用细菌裂解物的振动光谱进行深度学习分析,实现快速抗菌药物敏感性试验。ACS Nano 14, 15336–15348 (2020).
王,Y., 赵,Y., Bollas,A., 王,Y. & Au,K. F. 纳米孔测序技术、生物信息学及其应用。自然·生物技术 39, 1348–1365 (2021).
张,M.等.利用功能化纳米孔实时检测20种氨基酸并区分病理相关的肽段。自然方法杂志 21, 609–618 (2024).
应亚丽等。基于纳米孔的技术超越DNA测序。自然·纳米技术 17, 1136–1146 (2022).
Jena, M. K. & Pathak, B. 开发一种人工智能纳米孔,用于高通量DNA测序,采用机器学习辅助的量子隧穿方法。纳米快报 23, 2511–2521 (2023).
Taniguchi, M. 等人. 结合机器学习和纳米孔构建创建用于冠状病毒检测的人工智能纳米孔。自然通讯_nat. commun. 12, 3726 (2021).
夏凯等。合成肝素硫酸标准品和机器学习促进固态纳米孔分析的发展。 Proc. Natl Acad. Sci. USA 118, e2022806118 (2021).
李等人。利用蛋白质纳米孔识别标记糖类。自然通讯 14, 1737 (2023).
王尧等人。利用工程化纳米孔识别核苷单磷酸及其表观遗传修饰。自然·纳米技术 17, 976–983 (2022).
Greive, S. J., Bacri, L., Cressiot, B. & Pelta, J. 利用纳米孔和机器学习从生物流体中识别缓激肽生物标志肽的构象变异。 ACS纳米 18, 539–550 (2024).
萨尔达,P. 用于疾病检测和诊断的机器学习。年度生物医学工程评论 8, 537–565 (2006).
田福等人。利用细胞外囊泡的蛋白质分析监测和预测转移性乳腺癌的治疗反应。自然通讯_nat. commun. 12, 2536 (2021).
Sahu, A. 等人. 循环外泌体调节老化骨骼肌再生。自然·老化 1, 1148–1161 (2021).
芒加尔维德卡尔,R. 等人。利用神经形态定位显微镜实现纳米精度。自然·纳米技术 18, 380–389 (2023).
里斯等人。基于机器学习指导的发现19由自动化共聚物合成启用的fMRI造影剂。美国化学学会杂志 143, 17677–17689 (2021).
马昭,王芳,王伟,钟勇及戴辉. 基于深度学习的活体近红外成像。 Proc. Natl Acad. Sci. USA 118,e2021446118 (2021).
莫恩,E. 等人。细胞图像分析的深度学习。自然方法杂志 16, 1233–1246 (2019).
鲍尔夏德,C. 等。任务辅助GAN增强分辨率以指导光学纳米显微图像分析和获取。自然机器智能 5, 830–844 (2023).
朴 Jae 等人. 用于生命科学的人工智能赋能定量相位成像方法。自然方法杂志 20, 1645–1660 (2023).
Shmatko, A., Ghaffari Laleh, N., Gerstung, M. & Kather, J. N. 在病理学中的人工智能:增强癌症研究和临床肿瘤学。 Nat. Cancer 3, 1026–1038 (2022).
洪,G.等.利用新的近红外窗口进行颅内脑荧光成像。自然·光子学 8, 723–730 (2014).
陈, X. 等人. 用于深层无标记成像的人工共焦显微镜。自然·光子学 17, 250–258 (2023).
韩德,朴赫,黄世,金基. 基于复制和粘贴大脑的神经形态电子技术。自然·电子杂志 4, 635–644 (2021).
欧曼诺,M. & 余,H. 计算机断层扫描中金纳米颗粒定量的深度学习方法。物理医学 87, 83–89 (2021).
雷克尔,D. 等人。计算指导的自组装药物纳米粒子高通量设计。自然·纳米技术 16, 725–733 (2021).
薛,H. T. 等人。用于持续眼药递送的机器学习驱动多功能肽工程。自然通讯 14, 2509 (2023).
Castillo-Hair, S. M. & Seelig, G. 利用机器学习设计下一代mRNA治疗药物。 Acc. Chem. Res. 55, 24–34 (2022).
张,H.等.优化mRNA设计的算法提高了稳定性和免疫原性。自然 621, 396–403 (2023).
伊布拉希米,S. B.,萨曼塔,D.,库斯梅日克,C. D. & 米尔金,C. A. 基于球形核酸的蛋白质转染。自然协议期刊_nat. protoc.(原句无实际内容可翻译,保持不变) 17, 327–357 (2022).
黄俊等。通过机器学习管道识别具有强效抗菌肽,该管道挖掘整个肽序列空间。自然·生物医学工程 7, 797–810 (2023).
奥卡拉汉,J. 开源人工智能的文字转视频工具Sora如何改变科学——以及社会。自然 627, 475–476 (2024).
索普,H. H. ChatGPT很有趣,但不是作者。科学 379, 313 (2023).
特罗沙,A.,米尔斯,K. C. & 希基,A. J. 纳米材料数据库的可重复性、共享与进展。自然·纳米技术 12, 1111–1114 (2017).
德(D. Iglesia)等。从ClinicalTrials.gov识别涉及纳米药物和纳米设备的临床试验的机器学习方法。PLOS.ONE 9吴110331(2014).
Wyrzykowska, E. 等人. 预测性纳米信息学中纳米材料的表示和描述。自然·纳米技术 17, 924–932 (2022).
Ekins, S. 等人. 利用机器学习进行端到端的药物发现和开发。自然材料 18, 435–441 (2019).
艾里昂,G. 等。一种面向医疗应用AI模型开发的成本意识框架。自然医学与生物工程杂志 6, 1384–1398 (2022).
颜欣,Sedykh A,王维,颜波,朱虎。基于大数据管理和模型友好的纳米结构注释构建网络化纳米材料数据库。自然通讯 11, 2519 (2020).
王, Y. & 科汉, D. S. 外部触发和触发靶向策略在药物递送中的应用。自然·材料 2, 17020 (2017).
Ling, Q., Herstine, J. A., Bradbury, A. & Gray, S. J. 基于AAV的神经障碍在体基因治疗。自然·药物发现杂志 22, 789–806 (2023).
胡,S. 等人. 一种受贻贝启发的薄膜,用于粘附湿口腔组织和有效输送口腔药物。自然通讯 12, 1689 (2021).